La route traverse de part en part le transept ouvert à chacune de ses extrémités par une arcade en tiers-point qui repose sur de simples tailloirs. Sous le passage couvert, du côté de l’est, une arcade en plein cintre donne sur une sorte de crypte voûtée de pierre et éclairée de deux fenêtres. Cette chapelle n’est meublée que d’autel en tombeau galbé et d’une statue de la Vierge de la Médaille Miraculeuse. On y trouve étalement un bénitier et un linteau, provenant de la chapelle de Saint-Just, aujourd’hui disparue.
Vis à vis, une arcade semblable laisse voir un majestueux portail à quatre voussures en arc brisé. La dernière est reçu sur des colonnettes engagées à chapiteau orné de feuilles et de fleurs. Vient ensuite une belle porte, également en arc brisé, dont la mouluration, faite d’une gorge entre deus tores, se poursuit jusqu’à la base. Ce morceau d’architecture, s’il ne date pas du XIII ème siècle, comme on l’a parfois avancé, appartient du moins à la période gothique.
Autrefois, cette entrée solennelle desservait l’escalier qui montait à l’étage supérieur. Depuis 1893 ; elle débouche sur une petite grotte où la pieuse Bernadette s’agenouille devant l’apparition de Lourdes.